MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Escherichia coli S88 chromosome

Total Repeats: 90046

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011742	CAC	2	6	204	209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218556940
2	NC_011742	ACC	3	9	214	222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218556940
3	NC_011742	CGG	2	6	353	358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218556941
4	NC_011742	CAGG	2	8	419	426	25 %	0 %	50 %	25 %	218556941
5	NC_011742	CT	3	6	444	449	0 %	50 %	0 %	50 %	218556941
6	NC_011742	ACCA	2	8	465	472	50 %	0 %	0 %	50 %	218556941
7	NC_011742	GAT	2	6	482	487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218556941
8	NC_011742	A	6	6	490	495	100 %	0 %	0 %	0 %	218556941
9	NC_011742	CGC	3	9	569	577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218556941
10	NC_011742	TCG	2	6	613	618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218556941
11	NC_011742	TTG	2	6	663	668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218556941
12	NC_011742	CGCTG	2	10	692	701	0 %	20 %	40 %	40 %	218556941
13	NC_011742	CCG	2	6	848	853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218556941
14	NC_011742	TGG	2	6	931	936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218556941
15	NC_011742	ACT	2	6	958	963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218556941
16	NC_011742	GGC	2	6	977	982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218556941
17	NC_011742	TTG	2	6	998	1003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218556941
18	NC_011742	GTT	2	6	1067	1072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218556941
19	NC_011742	TTC	2	6	1126	1131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218556941
20	NC_011742	TGA	2	6	1232	1237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218556941
21	NC_011742	GGC	2	6	1328	1333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218556941
22	NC_011742	GC	3	6	1332	1337	0 %	0 %	50 %	50 %	218556941
23	NC_011742	GTG	2	6	1371	1376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218556941
24	NC_011742	ATC	2	6	1388	1393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218556941
25	NC_011742	TG	3	6	1434	1439	0 %	50 %	50 %	0 %	218556941
26	NC_011742	AAG	2	6	1483	1488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218556941
27	NC_011742	GGT	2	6	1535	1540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218556941
28	NC_011742	TCT	2	6	1635	1640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218556941
29	NC_011742	GAT	2	6	1671	1676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218556941
30	NC_011742	TCA	2	6	1700	1705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218556941
31	NC_011742	GCT	2	6	1772	1777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218556941
32	NC_011742	GAA	2	6	1808	1813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218556941
33	NC_011742	GAA	2	6	1902	1907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218556941
34	NC_011742	ATC	2	6	1966	1971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218556941
35	NC_011742	TTG	2	6	1987	1992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218556941
36	NC_011742	CCAG	2	8	2002	2009	25 %	0 %	25 %	50 %	218556941
37	NC_011742	GTT	2	6	2055	2060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218556941
38	NC_011742	TCG	2	6	2085	2090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218556941
39	NC_011742	TAC	2	6	2097	2102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218556941
40	NC_011742	GCG	2	6	2118	2123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218556941
41	NC_011742	TGA	2	6	2213	2218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218556941
42	NC_011742	TGA	2	6	2221	2226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218556941
43	NC_011742	GAT	2	6	2349	2354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218556941
44	NC_011742	ATTGAA	2	12	2430	2441	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	218556941
45	NC_011742	TGC	2	6	2446	2451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218556941
46	NC_011742	CGC	2	6	2480	2485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218556941
47	NC_011742	CGA	2	6	2510	2515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218556941
48	NC_011742	CG	3	6	2525	2530	0 %	0 %	50 %	50 %	218556941
49	NC_011742	TGA	2	6	2546	2551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218556941
50	NC_011742	TGA	2	6	2582	2587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218556941
51	NC_011742	TAT	2	6	2685	2690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218556941
52	NC_011742	GCG	2	6	2863	2868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218556942
53	NC_011742	GGC	2	6	2916	2921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218556942
54	NC_011742	CAA	2	6	2937	2942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218556942
55	NC_011742	GCAA	2	8	3029	3036	50 %	0 %	25 %	25 %	218556942
56	NC_011742	ATGA	2	8	3127	3134	50 %	25 %	25 %	0 %	218556942
57	NC_011742	GCA	2	6	3206	3211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218556942
58	NC_011742	TGG	2	6	3243	3248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218556942
59	NC_011742	TGA	2	6	3257	3262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218556942
60	NC_011742	GAA	2	6	3265	3270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218556942
61	NC_011742	CAT	2	6	3276	3281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218556942
62	NC_011742	TGA	2	6	3303	3308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218556942
63	NC_011742	CGC	2	6	3385	3390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218556942
64	NC_011742	ATTGC	2	10	3395	3404	20 %	40 %	20 %	20 %	218556942
65	NC_011742	TTCA	2	8	3427	3434	25 %	50 %	0 %	25 %	218556942
66	NC_011742	TGA	2	6	3473	3478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218556942
67	NC_011742	AGCG	2	8	3564	3571	25 %	0 %	50 %	25 %	218556942
68	NC_011742	TCCGGC	2	12	3577	3588	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	218556942
69	NC_011742	TG	3	6	3605	3610	0 %	50 %	50 %	0 %	218556942
70	NC_011742	CGG	2	6	3704	3709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218556942
71	NC_011742	CTGA	2	8	3850	3857	25 %	25 %	25 %	25 %	218556943
72	NC_011742	TGA	2	6	3861	3866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218556943
73	NC_011742	TGA	2	6	3924	3929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218556943
74	NC_011742	CG	3	6	3961	3966	0 %	0 %	50 %	50 %	218556943
75	NC_011742	CGG	2	6	4059	4064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218556943
76	NC_011742	GGC	2	6	4252	4257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218556943
77	NC_011742	TGA	3	9	4323	4331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218556943
78	NC_011742	CTA	2	6	4404	4409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218556943
79	NC_011742	GC	3	6	4441	4446	0 %	0 %	50 %	50 %	218556943
80	NC_011742	CGG	2	6	4493	4498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218556943
81	NC_011742	CTG	2	6	4501	4506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218556943
82	NC_011742	TGC	2	6	4542	4547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218556943
83	NC_011742	ACG	2	6	4583	4588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218556943
84	NC_011742	GATG	2	8	4632	4639	25 %	25 %	50 %	0 %	218556943
85	NC_011742	AGCC	2	8	4642	4649	25 %	0 %	25 %	50 %	218556943
86	NC_011742	AAC	2	6	4651	4656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218556943
87	NC_011742	GTT	2	6	4674	4679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218556943
88	NC_011742	CCG	2	6	4680	4685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218556943
89	NC_011742	GAT	2	6	4726	4731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218556943
90	NC_011742	AG	3	6	4881	4886	50 %	0 %	50 %	0 %	218556943
91	NC_011742	CCG	2	6	4973	4978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218556943
92	NC_011742	TGC	2	6	4983	4988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218556943
93	NC_011742	TGA	3	9	5000	5008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218556943
94	NC_011742	ATC	2	6	5009	5014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218556943
95	NC_011742	TGG	2	6	5398	5403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218556944
96	NC_011742	ACA	2	6	5406	5411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218556944
97	NC_011742	CCG	2	6	5449	5454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218556944
98	NC_011742	CGC	2	6	5459	5464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218556944
99	NC_011742	ATC	2	6	5483	5488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218556944
100	NC_011742	ATC	2	6	5495	5500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218556944
101	NC_011742	CAT	2	6	5518	5523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218556944
102	NC_011742	GCT	2	6	5574	5579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218556945
103	NC_011742	GGA	2	6	5611	5616	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218556945
104	NC_011742	TCA	2	6	5621	5626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218556945
105	NC_011742	AAG	2	6	5627	5632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218556945
106	NC_011742	CAGT	2	8	5652	5659	25 %	25 %	25 %	25 %	218556945
107	NC_011742	AAT	2	6	5686	5691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218556945
108	NC_011742	TCA	2	6	5700	5705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218556945
109	NC_011742	TTC	2	6	5753	5758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218556945
110	NC_011742	TTC	2	6	5798	5803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218556945
111	NC_011742	CAC	2	6	5845	5850	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218556945
112	NC_011742	TGC	2	6	5863	5868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218556945
113	NC_011742	TTG	2	6	5885	5890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218556945
114	NC_011742	TGA	2	6	5892	5897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218556945
115	NC_011742	AAATCG	2	12	6038	6049	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	218556945
116	NC_011742	AGCG	2	8	6156	6163	25 %	0 %	50 %	25 %	218556945
117	NC_011742	GCT	2	6	6246	6251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218556945
118	NC_011742	GTG	2	6	6287	6292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218556945
119	NC_011742	CAT	2	6	6429	6434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218556946
120	NC_011742	ACGC	2	8	6496	6503	25 %	0 %	25 %	50 %	218556946
121	NC_011742	GCC	2	6	6646	6651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218556946
122	NC_011742	GTT	2	6	6700	6705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218556946
123	NC_011742	AGA	2	6	6717	6722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218556946
124	NC_011742	ATC	2	6	6944	6949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218556946
125	NC_011742	GCTGCC	2	12	6992	7003	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	218556946
126	NC_011742	CGC	2	6	7090	7095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218556946
127	NC_011742	GCC	2	6	7096	7101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218556946
128	NC_011742	GCCA	2	8	7113	7120	25 %	0 %	25 %	50 %	218556946
129	NC_011742	CAGG	2	8	7186	7193	25 %	0 %	50 %	25 %	218556946
130	NC_011742	CAG	2	6	7273	7278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218556946
131	NC_011742	AAT	2	6	7294	7299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218556946
132	NC_011742	CG	3	6	7440	7445	0 %	0 %	50 %	50 %	218556946
133	NC_011742	AGA	2	6	7566	7571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218556946
134	NC_011742	CGG	2	6	7587	7592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218556946
135	NC_011742	CG	3	6	7632	7637	0 %	0 %	50 %	50 %	218556946
136	NC_011742	CAA	2	6	7766	7771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218556946
137	NC_011742	TAA	2	6	7821	7826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218556946
138	NC_011742	A	6	6	7832	7837	100 %	0 %	0 %	0 %	218556946
139	NC_011742	GCAT	2	8	7842	7849	25 %	25 %	25 %	25 %	218556946
140	NC_011742	ACC	2	6	8157	8162	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218556947
141	NC_011742	CAAC	2	8	8221	8228	50 %	0 %	0 %	50 %	218556947
142	NC_011742	TC	3	6	8232	8237	0 %	50 %	0 %	50 %	218556947
143	NC_011742	CGCAG	2	10	8246	8255	20 %	0 %	40 %	40 %	218556947
144	NC_011742	TTGA	2	8	8274	8281	25 %	50 %	25 %	0 %	218556947
145	NC_011742	CAG	2	6	8304	8309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218556947
146	NC_011742	CG	3	6	8319	8324	0 %	0 %	50 %	50 %	218556947
147	NC_011742	CAG	2	6	8325	8330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218556947
148	NC_011742	CGAC	2	8	8341	8348	25 %	0 %	25 %	50 %	218556947
149	NC_011742	TGC	2	6	8546	8551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218556947
150	NC_011742	AAG	2	6	8566	8571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218556947
151	NC_011742	CTG	2	6	8592	8597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218556947
152	NC_011742	TTG	2	6	8656	8661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218556947
153	NC_011742	AAGA	2	8	8697	8704	75 %	0 %	25 %	0 %	218556947
154	NC_011742	AGA	2	6	8717	8722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218556947
155	NC_011742	TAC	2	6	8757	8762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218556947
156	NC_011742	CTG	2	6	8865	8870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218556947
157	NC_011742	GTGAA	2	10	8923	8932	40 %	20 %	40 %	0 %	218556947
158	NC_011742	GCA	2	6	8972	8977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218556947
159	NC_011742	A	6	6	9052	9057	100 %	0 %	0 %	0 %	218556947
160	NC_011742	CTG	2	6	9069	9074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218556947
161	NC_011742	TGA	2	6	9190	9195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218556948
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163	NC_011742	GAA	2	6	9276	9281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218556948
164	NC_011742	ATC	2	6	9348	9353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218556948
165	NC_011742	TG	3	6	9364	9369	0 %	50 %	50 %	0 %	218556948
166	NC_011742	TGG	2	6	9373	9378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218556948
167	NC_011742	CAC	2	6	9404	9409	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218556948
168	NC_011742	CGT	2	6	9429	9434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218556948
169	NC_011742	CGTAC	2	10	9674	9683	20 %	20 %	20 %	40 %	218556948
170	NC_011742	GCA	2	6	9735	9740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218556948
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172	NC_011742	AGAT	2	8	10051	10058	50 %	25 %	25 %	0 %	218556949
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174	NC_011742	CAG	2	6	10137	10142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218556949
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177	NC_011742	AGAA	2	8	10325	10332	75 %	0 %	25 %	0 %	218556949
178	NC_011742	T	6	6	10371	10376	0 %	100 %	0 %	0 %	218556949
179	NC_011742	CAG	2	6	10383	10388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218556949
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211	NC_011742	TGGT	2	8	12359	12366	0 %	50 %	50 %	0 %	218556952
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233	NC_011742	CAG	2	6	13042	13047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218556952
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249	NC_011742	CAG	2	6	14020	14025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218556952
250	NC_011742	CAG	3	9	14035	14043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218556952
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256	NC_011742	ACC	2	6	14313	14318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218556953
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261	NC_011742	GGC	2	6	14525	14530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218556953
262	NC_011742	GTC	2	6	14538	14543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218556953
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269	NC_011742	GCA	2	6	14841	14846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218556953
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292	NC_011742	AATC	2	8	16656	16663	50 %	25 %	0 %	25 %	218556955
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389	NC_011742	CGAT	2	8	21798	21805	25 %	25 %	25 %	25 %	218556959
390	NC_011742	CAG	2	6	21812	21817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218556959
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392	NC_011742	CGT	2	6	21914	21919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218556959
393	NC_011742	TGA	2	6	22012	22017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218556959
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438	NC_011742	CAT	2	6	24409	24414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218556963
439	NC_011742	CG	3	6	24416	24421	0 %	0 %	50 %	50 %	218556963
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499	NC_011742	TG	3	6	28233	28238	0 %	50 %	50 %	0 %	218556966
500	NC_011742	AGT	2	6	28431	28436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218556966

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